Page 58 - 《环境工程技术学报》2022年第5期
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· 1414 ·                                环境工程技术学报                                         第 12 卷

             1.2.4 数据处理                                        中,判别能力分析对备选指标进              行  Pearso 相关性分
                                                                                                   n
                使  用  Fastp(version 0.20.0)软件对原始测序序列           析, 若  2  个指标的相关性系数(R)≥0.70,表明二者所
            进行质控,使      用  Flash(version 1.2.7)软件进行拼接:         反映的信息重叠性较大,选择其中之一用于构                     建  M-
            1)过滤序列(reads)尾部质        量  20 b 以下的碱基,设            IB 评价体系。
                                           p
                                                                 I
            置  50 b 的窗口,如果窗口内的平均质量低                于  20 bp,    1.3.3 M-IB 的计分及评价标准
                                                                         I
                   p
            从窗口开始截去后端碱基,过滤质控                后  50 b 以下的            采用比值法计      算  M-IBI。其中,对随干扰增大而
                                                   p
            序列(reads),去除含氮碱基的序列(reads);2)根据                    减小的指标,各指标的分值等于指标值除以所有采
            PE 序列之间的重叠(overlap)关系,将成对序列拼接                      样点  的  95 %  分位数;对随干扰增大而增大的指标,以
            (merge) 成  1  条序列,最小重叠(overlap)长度         为  10    所有采样点     的  5 %  分位数为最佳期望值进行计算。
            bp;3)拼接序列的重叠区允许的最大错配比率为                            计算方法:(最大值-指标值)/(最大值-5                  %  分位
            0.2,筛选不符合序列;4)根据序列首尾两端的标签序                         数)。该方法规定,经计算后的分值分布                  为  0~1,若
            列(barcode)和引物区分样品,并调整序列方标签序                        大 于  1,则记  为  1。以参考   点  IB 的 I  95 %  分位数作为
            列(barcode)允许的错配数       为  0,最大引物错配数       为  2。    健康评价的最佳值,低于该值的分布范围进行五等
                使  用  UPARSE(version 7.1)软件根   据  97 %  的相     分,靠  近  95 %  分位数的一等分代表被测样点处于健
            似度对序列进行          OT U  聚类并剔除嵌合体。利用                 康状态,随后依次是亚健康、一般、较差和极差的划
            RDP classifier (version 2.2 软件对每条序列进行物             分标准。
                                   )
            种分类注释,比       对  Silva 16S rRN 数据库,设置比对
                                         A
                                                                2 结果与分析
            阈值  为  70%。
             1.3 M-IBI 评价体系的构建                                  2.1 关键因子的确认
             1.3.1 参考点与污染点的区分                                      研究区各采样点微生物信息通过高通量测序进
                基  于  GB 3838—2002《地表水环境质量标准》对                 行 分 析 , 共 获 得   986  14 条 序 列 , 选 择  Shannon、
                                                                                     8
            水 样  TP、石油类、NH -N、DO、COD 、BOD 、TN、                 Simpson、Ace、Chao、Coverag 和    P 多样性指数进
                                                                                         e
                                                                                              D
                                             Cr
                                3
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            As、p H  这  9  项因子进行赋分,即达到Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、                    行分析,各采样点微生物多样性指数分析结果如                     表  1
            Ⅳ和Ⅴ类水质标准,分别记             为  5、4、3、2、 分,未达          所示。Shannon、Simpso 和      P D  指数反映群落多样
                                                                                    n
                                                 1
            Ⅴ类水质标准,计        为  0  分,对各指标求平均值即可得                性,Ac 和   Cha 指数反映群落丰富度,Coverag 指
                                                                    e
                                                                                                         e
                                                                            o
            到该采样点水质总得分。水质总得分大                  于  90 %  分位     数反映群落覆盖度。由          表  1 可知,永定河    的  Shannon、
            数的采样点为参考点,其他采样点为受人类影响较                             Ace、Chao、Coverag 和   P D  多样性指数与清河、凉
                                                                                e
            大的干扰位点。其中,水质总得分小                 于  10 %  分位数      水河和大龙河存在显著差异。
            的采样点为高度受干扰位点,10%~90                %  分位数的             各河道采样点主要水质指标测定及得分计算结
            采样点为中度受干扰位点 。                                      果如  表  2  所示。1 个采样点的水质总得分            为  3.22~
                                   [19]
                                                                              5
             1.3.2 备选指标的确定与筛选                                  4.22,50 %  和  95 %  分位数分别为    3.5 和  4.00。因
                                                                                                6
                选取与微生物群落丰富度、结构、组成和功能                           此,水质总得分大        于  4.0 的采样点(YDH1、YDH2)
                                                                                    0
            相关的参数作为计         算  M-IB 的备选指标。其中,与                为低干扰点,即参考点;水质总得分               为  3.56~4.0 和
                                                                                                         0
                                     I
            群落组成相关的参数选择主要涉及优势种分布及与                             小 于  3.5 的采样点分别为中等( 个)和较高( 个)
                                                                                                        3
                                                                                            9
                                                                      6
            水质变化密切相关的微生物组成;与功能相关的微                             干扰强度点,均为污染点。
            生物主要包括致病菌、污染物降解菌和参与营养物                                 采 用  RD A  分析微生物群落结构变化与水质指
            质代谢循环的菌属。通            过  RD A  分析筛选关键的环            标间的关系,结果如          图  2  所示。由   图  2  可知,TN、
            境因子,利用加权平均回归的方法计算各分类单元                             TP、NH -N、NO -  N  和  NO - N  与微生物群落分布具
                                                                     3       3        2
            的最适值,运算方法参照文             献  [1]。通过采用典型相            有显著相关关系(P<0.05)。氮和磷浓度均是影响微
            关分析    和  Spearma 相关性分析,明确显著影响河道                   生物群落结构的重要因素,不同微生物对氮和磷的
                            n
            微生物群落组成的水质指标及其与各类微生物间的                             耐受程度存在差别。
            相关系数和显著性。其中,与关键水质指标显著相                                 分析存在显著相关性的水质指标(TN 、TP、
            关的微生物组成可作为备选指标。参照文                    献  [20-24]   NH -N、NO - N  和  NO -N ) 与 微 生 物 群 落 之 间的
                                                                  3      3        2
            对备选指标进行干扰反应、判别能力分析和相关性                             Spearma 相关性,结果如       图  3  所示。由  图  3  可知,放
                                                                      n
            分析,筛选出用以计          算  M-IB 的生物参数指标。其               线菌门(Actinobacteriota)的相对丰度     与  TP、NO - 和
                                      I
                                                                                                         N
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